BLOG

Update tình hình dịch virus Corona Vũ Hán, nCoV2019

vietbio 26.05.2020
710 người theo dõi 122 bình luận 67 bài chia sẻ

Tôi tạo blog này nhằm tạo điều kiện mọi ng có thể dễ dàng theo dõi các tin tức khoa học mới nhất về virus Corona nCoV2019. Lưu ý, tôi ko phải là bác sĩ dịch tễ học, cùng không phải là chuyên gia y tế cộng đồng nhưng tôi, theo cách nói thông thường, có hiểu biết khoa học cơ bản để phiên dịch các thông tin từ các chuyên gia khoa học, với sự cẩn trọng về độ tin cậy, giới hạn của các giả định và độ không chắc chắn. Tuy nhiên, bạn cần lưu ý đây là 1 sự kiện diễn tiến nhanh chóng, do đó các sự thật (bao gồm dữ liệu và cách diễn giải dữ liệu) rất có thể thay đổi (ví dụ khi có thêm dữ liệu mới).



https://twitter.com/i/status/1239280958077120512

{Nghiên cứu từ Vũ Hán, 15.02.20 21:57}: Nghiên cứu mới từ nhóm y tế ở Vũ Hán trên 8000 người đã tiếp xúc trực tiếp với người đã mắc COVID-19 thì thấy khoảng 30% số người này sau đó có kết quả xét nghiệm dương tính với SARS-CoV-2. Tỷ lệ lây nhiễm này là rất lớn và cho thấy bệnh dịch lây lan rất mạnh. Tuy nhiên may mắn là phần lớn những người bị lây nhiễm đều chỉ có triệu chứng nhẹ và thường ko đủ bệnh lý để yêu cầu phải điều trị y tế cho đến thời điểm nghiên cứu [4], với giả định là những người tiếp xúc này đều bị cách ly và theo dõi sức khỏe.

[4] DOI: 10.1101/2020.02.12.20022327.


{Tên chính thức, 15.02.20 21:57}: Tên chính thức của bệnh là COVID-19, còn tên của virus giờ là SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2).



{Phỏng đoán tiến triển dịch nCoV2019, 11.02.20 16:47} Maria Van Kerkhove, nhà dịch tễ học của WHO, đã phân tích dữ liệu của 17,000 trường hợp nhiễm nCoV2019 và chỉ ra rằng 82% trường hợp là có triệu chứng nhẹ, 15% nặng và 3% đặc biệt nghiêm trọng [3]. Các con số này chỉ mang tính chất tham khảo vì nó chỉ dựa vào những trường hợp đã được hệ thống y tế TQ thống kê mà ko có nghiên cứu nền ngẫu nhiên trên quần thể với số lượng lớn. Do đó, có thể hy vọng tỷ lệ nhiễm nCoV2019 nặng và trầm trọng trong thực tế còn thấp hơn. Mặt khác, càng nhiều số lượng người nhiễm nCoV2019 không được xác định và kiểm soát nghĩa là nCoV2019 càng nhiều cơ hội tạo thêm những đường truyền nhiễm qua nhiều thế hệ trong cộng đồng. Việc phong tỏa và hạn chế với các thành phố ở TQ cũng như một số nơi khác có thể giúp làm giảm sự truyền nhiễm.

[3] https://twitter.com/HelenBranswell/status/1225823180243324929



{nCoV2019 genome từ VN, 11.02.2020 10:24} Mẫu nCoV2019 genome từ Thanh Hóa (25.01.20) cho thấy mang nhiều biến đổi (8, nhiều nhất so với tất cả 80 trình tự nCoV2019 [2] đã biết và 3 điểm đặc hữu khác với các mẫu nCoV2019 đã biết) so với chủng gốc, một số biến đổi này xuất hiện ở mẫu từ Tứ Xuyên (16.01.20) và Los Angeles (24.01.20). So sánh với 4 mẫu nCoV2019 mới bổ sung cùng thời điểm từ Nhật Bản thì 3 mẫu Tokyo nằm cùng 1 nhóm với nhau (cho thấy có thể chung 1 nguồn gốc) và mẫu Kyoto có 2 điểm khác biệt đặc hữu so với các mẫu nCoV2019 đã biết. Việc phát hiện liên tục các điểm biến đổi là chỉ dấu cho thấy virus tiếp tục biến đổi trong quá trình truyền nhiễm trong quần thể người, điều đó gây quan ngại về những diễn biến khó lường (vd. xuất hiện chủng virus mới với những đặc điểm khác với chủng gốc về độc tính hoặc con đường lây nhiễm).

[2] @next strains: nCoV report dated 11.02.20



{nCoV2019 và HIV, 11.02.202 09:38}: Công trình (đăng tải không qua kiểm duyệt đồng cấp) từ nhóm nghiên cứu Ấn độ [1] phát hiện những đoạn ngắn tương đồng giữa virus nCoV2019 và đoạn mã hóa protein gp120 và Gag từ HIV-1, nay đã bị BÁC BỎ. Chất lượng của nghiên cứu này bị hoài nghi là kém và sai sót, 04 đoạn tương đồng phát hiện hoặc (1) quá ngắn ko hề đặc trưng cho HIV-1 và có thể tìm thấy ở rất nhiều sinh vật khác, hoặc (2) là do sai sót kỹ thuật. Do đó, giả thuyết liên quan là nCoV2019 là sản phẩm chế tạo từ phòng thí nghiệm cũng không / chưa ko có bằng chứng khoa học hỗ trợ. 

[1] DOI: 10.1101/2020.01.30.927871

§1. Dữ liệu hệ genome nCoV2019 chỉ ra rằng nCoV2019 là một thành viên của nhóm virus kiểu SARS. Những virus này trong tự nhiên tồn tại chủ yếu ở dơi và biến đổi liên tục trong quá trình này. Virus SARS năm 2002-03 và nCoV năm 2019-20 chứa những biến đổi khiến virus có khả năng thích ứng và lây nhiễm sang người, và từ người này sang người khác.

§2. Một giả thuyết nCoV2019 khác (Dr. Lyons-Weiler) là sản phẩm tái tổ hợp được xây dựng dựa trên phân tích so sánh toàn bộ hệ genome của nCoV2019 với SARS từ dơi, cho thấy rằng có tồn tại những đoạn đặc biệt được chèn thêm vào nCoV2019 mà ko có ở SARS tự nhiên từ dơi. Khi tìm kiếm nguồn gốc của đoạn chèn thì thấy sự tương đồng tương đối với hệ thống plasmid tái tổ hợp pShuttle-SN được dùng trong phòng thí nghiệm. Tuy nhiên giả thuyết này này bị BÁC BỎ do (1) đoạn tương đồng đó chính là mục đích thiết kế pShuttle-SN nhằm tạo vaccine chống SARS, và rằng (2) nếu là sản phẩm từ phòng thí nghiệm thì mức tương đồng phải gần 100% nhưng ở đây chỉ là 60%, quá ít để coi là bằng chứng khoa học thuyết phục.

{Chợ Hải sản Vũ Hán, 11.02.20 00:26}: Thêm 2 hệ genome của nCoV2019 được giải trình tự. Đây là 2 mẫu phân lập từ chợ Hải sản Hoa Nam tại Vũ Hán. Kết quả phân tích cho thấy 2 trình tự mới phân cùng nhóm với các trình tự nCoV2019 được phân lập trước đây từ người bệnh [hiện bao gồm tổng số 80 hệ genome, trong đó có TQ (45), USA (8), Pháp (4), Australia (4), Singapore (3), Việt Nam (1, từ Thanh Hóa)]. Điều đó ủng hộ thêm giả thuyết rằng chợ này là nguồn gốc của đợt bùng phát đầu tiên. 

§1. Mặc dù chợ tên là Hải sản nhưng rất nhiều loại động vật hoang dã được bày bán ở đây. Mức độ nhiễm virus cao tại khu vực này có thể liên quan đến hoạt động mổ xẻ thịt của một động vật nhiễm virus nCoV2019. Dù thế nào đi nữa, virus nCoV2019 sau đó đã phát triển để truyền nhiễm từ người sang người.

§2. Các dữ liệu dịch tễ cho thấy mặc dù đa số các ca nhiễm đầu tiên ở Vũ Hán có liên quan đến chợ Hải sản, tuy nhiên cũng đồng thời có 1 vài trường hợp sớm nhiễm nCoV2019 mà ko có bất kỳ mối liên hệ nào đến chợ Hải sản Hoa Nam. Với kết quả giải trình tự mới từ các mẫu môi trường ở chợ Hải sản, dường như chợ Hải sản này là nguồn gốc của thế hệ virus mà sau đó đã lây nhanh từ người sang người ở khắp TQ và toàn cầu.



3 Bình luận
Website liên kết